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高温烧菌培养室温度太高，杂菌易生长；发菌期菌袋内温度升至32弋以上，没及时疏袋散热，造成烧袋，致使绿霉等杂菌严重感染。培菌时有两个升温关键期，一是菌种萌发覆盖料面后的迅速生长期；二是早春气温迅速升高。高温烧菌后，病害症状没及时表现出来，但由于灵芝菌丝受损严重，芝棒割袋下地后，病害很快爆发。芝棒菌丝体成熟度不足灵芝菌丝体成熟度不足，菌丝体抗性弱，芝棒下地、菌袋剪口后仍易感染杂菌。阳光暴晒菌袋菌袋覆土后，日照强烈，迅速升温，芝棚遮阳度小（甚至没有遮阳），致使菌袋菌丝体被太阳暴晒受损后感染杂菌。芝棒下地后灌水由于是不完全脱袋栽培，芝棒下地后灌水，菌木表面及菌袋内的水份不能很快从袋内蒸发出来，过高的土壤水份会切断段木菌丝的氧气供给，致使芝棒呼吸不畅窒息死亡后感染杂菌。防治措施针对芝棒污染原因和引发途径，生产上，要掌握灵芝品种的特征特性，提供适宜其生长的环境条件，规范操作，并贯彻为主的方针，避免或减少芝棒感染杂菌。
酸、碱降解法．酸、碱降解法利用无机或有机酸、碱等破坏灵芝孢子细胞壁中几丁质、纤维素等成分的结构，使其有效成分易于溶出．使用无机酸或有机酸溶液热处理灵芝孢子提取灵芝多糖，多糖中分子量在2000~4900Da的部分均在60%以上.物理法物理法的工作原理各异，优缺点也不相同，总体来说，物理法的能量消耗较大，且设备较为复杂、投资较大．低温冷冻法．低温冷冻法利用灵芝孢子中的水分在低温条件下结晶、结晶长大等作用破坏灵芝孢子细胞壁．例如，金刚阴在实验中将灵芝抱子在-20T反复冻融，其破壁率高达99.5%．超声波法．超声波法主要利用超声的空机械振动和空化效应来破坏灵芝抱子细胞壁.例如，Alzorqi等利用超声波提取P-D-葡聚糖,在优化条件下p-D-葡聚糖的产量为5.228mg/g．波法．波法利用波的穿透能力和热效应，使细胞内部的温度迅速上升，从而使细胞内部的压力超过细胞壁膨胀所能承受的压力而破碎，促使其有效成分释放．例如，先将灵芝抱子进行波处理，而后在低温深加工，灵芝抱子的破壁率可达99%以上．
2008年以来浙江省中药产业协会将灵芝重点扶持产业，市场上灵芝产品越来越多，包括灵芝子实体、抱子粉、菌丝体为主要成分的和药品，广泛应用于肿瘤、冠心病、心绞痛、高脂血症、高血压病、、慢性支气管炎和哮喘、神经衰弱、肝炎等。但国内外灵芝药材及其产品均无系统的质量控制体系，对灵芝及其产品质量的控制大多都停留在主要活性成分定性评价的水平上，灵芝品种使用也是几十年一成不变，单一品种的重复使用，菌种种性退化明显，与“、有效、稳定、可控叩勺中药现代化、国际化要求存在相当差距，建立灵芝功效成分定性与定量结合的评价方法，控制灵芝及其产品质量，对灵芝产业可持续发展具有重要意义。河南驻马店市近几年研究推广段木熟料栽培灵芝，其产品质量可靠，效益较好。2009年至2010年度，有部分芝农，因前期发菌、芝棒下地等技术环节管理不到位及春季天气温度低等方面的原因，芝棒污染严重，造成了资源浪费及经济损失，个别地方因此产生菌种质量纠纷，影响着灵芝产业的发展。对此，笔者对我市灵芝主产区的芝棒污染原因进行了专门的调查研究，并提出了相应的措施。
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